Após estar concluída a instalação do sistema num servidor Web, o Director configura o sistema através dos cinco passos, preenchendo formulários e definindo a administração da revista. Não é obrigatório configurar a revista de uma vez: os formulários podem ser preenchidos aos poucos e guardados; o Director pode retornar à Configuração para concluir as tarefas ou alterar informações a qualquer momento.

A Configuração está disponível para o Director na página de Administração da Revista e contém o seu próprio conjunto de textos de Ajuda construídos em cada um dos formulários. Configurar o portal da revista vai exigir decisões e textos para os seguintes itens, dentre outros, que podem ser preparados em conjunto com os Editores ou incluídos mais tarde.

• Contacto Principal da Revista
• Contacto Técnico
• Indicação do Âmbito da Revista
• Políticas e Secções da Revista
• Directrizes para Submissão
• Requisitos de Submissão para o Autor
• Elementos de Indexação e exemplos apropriados
• Política de Revisão por Pares
• Directrizes para Revisão
• Política de Direitos de Autor
• Política de Acesso Livre
• Equipa Editorial/Equipa Revisores
• Política de Subscrições
• Uso de Editores de Layout, Editores de Texto, e/ou Leitores de Prova